簡單快速地檢測具有單核苷酸特異性靶基因的方法,可能會為實驗室以外的領域提供遺傳學研究和診斷方法。本文最近報道了一種用于電子檢測未擴增目標基因的生物傳感器,該傳感器使用液體門控石墨烯場效應晶體管,采用錨定在石墨烯單層上的RNA引導催化失活CRISPR關聯(lián)蛋白9 (Cas9)。在這里,使用來自未經擴增的患者基因組樣本,并通過測量多種類型的電響應,該生物傳感器可以在一小時之內區(qū)分出一個核苷酸的野生型和純合突變等位基因。同時,使用引導RNA-Cas9同源復合物的生物傳感器,針對來自鐮狀細胞病患者的純合子和雜合子DNA樣本,區(qū)分了原間隔-鄰近基序中的基因,并且該生物傳感器也可以用于快速篩選引導RNA-Cas9復合物,最大限度地提高了基因靶向效率。
Fig. 1 借助CRISPR技術的gFET,可無擴增地檢測單核苷酸突變。
Fig. 2 SNP-Chip可以區(qū)分不同的擴增子DNA樣本,其差異在于gRNA靶位點上的單個核苷酸。
Fig. 3 基于dCas9和Cas9的SNP芯片,從基因組DNA樣品中檢測與SCD相關的SNP。
Fig. 4 SNP芯片可以區(qū)分有無SOD1 SNP的樣品。
Fig. 5 MgaCas9 SNP芯片構建體評估gRNA活性和雜合性。
相關研究成果于2021年由美國克萊蒙特學院Kiana Aran課題組,發(fā)表在Nature Biomedical Engineering(https://doi.org/10.1038/s41551-021-00706-z)上。原文:Discrimination of single-point mutations in unamplified genomic DNA via Cas9 immobilized on a graphene field-effect transistor。
轉自《石墨烯雜志》公眾號